-- 巴斯夫開放其包含數(shù)百萬條目的物質(zhì)庫,供科研團隊免費使用
-- 超級計算機Quriosity助力公共研究項目識別并優(yōu)化潛力分子
作為“‘手'護”行動的一部分,巴斯夫不僅捐贈了大量消毒劑和防護口罩,還在全球范圍內(nèi)為學(xué)術(shù)研究團體提供支持,幫助尋找合適的活性成分,用于治療感染新冠肺炎的患者。巴斯夫生物科學(xué)研究平臺總裁Peter
Eckes博士表示:“雖然我們沒有藥物活性成分研發(fā)業(yè)務(wù),但巴斯夫在物質(zhì)研究方面擁有超過150年的經(jīng)驗。這意味著我們擁有大量的相關(guān)知識和囊括多種活性成分的大型物質(zhì)庫?!卑退狗蜻€開發(fā)了自己的計算機程序,用于分子設(shè)計,并擁有自己的超級計算機Quriosity。Eckes補充道:“充分發(fā)揮我們強大的研究能力,為抗擊新冠疫情貢獻(xiàn)一份力量?!睘榇?,巴斯夫正通過多種方式幫助尋找病毒解藥。
為快速找到有效抑制新冠病毒的活性成分,世界各地的學(xué)術(shù)機構(gòu)正通過細(xì)胞培養(yǎng)測試已批準(zhǔn)藥物的有效性,雖然這些藥物已用于治療其他病毒性疾病,但可能對新冠病毒作用有限,因此有必要尋找活性成分的改進(jìn)衍生物。為此,巴斯夫研究人員對公司內(nèi)部包含數(shù)百萬種分子的物質(zhì)庫進(jìn)行了計算機輔助搜索,以尋找類似的化合物,并最終確定了150種有希望的候選化合物。巴斯夫免費向各大學(xué)術(shù)工作團隊提供這些化合物,并允許其用于研究,無需支付任何專利費。巴斯夫生物科學(xué)研究員Matthias
Witschel博士說道:“多年來,我們一直在支持瘧疾等傳染病的藥物學(xué)術(shù)研究。因此,‘手'護行動才能迅速調(diào)用我們早已建立的人脈和流程?!?
用超級計算機Quriosity模擬活性分子
來自計算化學(xué)部的化學(xué)家們提出了第二種尋找活性成分的方法,即利用計算機領(lǐng)域知識。隨后,他們得知一家生物技術(shù)公司PostEra正開展COVID-19
Moonshot項目,參與該項目的全球科學(xué)家自愿幫助尋找一種抑制劑,通過抑制新冠病毒必需的一種酶——病毒主蛋白酶,阻止病毒在人體內(nèi)自我復(fù)制。巴斯夫研究人員也加入其中,共同尋找有效抑制劑,在巴斯夫內(nèi)部開發(fā)的計算機程序和超級計算機Quriosity的幫助下設(shè)計出許多新型分子。最終,他們通過模擬找到了20個最適合主蛋白酶活性位點的分子,并將相關(guān)分子信息免費提供給該項目,作進(jìn)一步研究。
巴斯夫數(shù)字生物科學(xué)研究部的計算化學(xué)主任Klaus-Jürgen
Schleifer教授解釋道:“然而,這些通過計算機模擬得來的分子,我們并不確定它們能否被合成,合成度有多高。”針對這一問題,巴斯夫研究人員也在嘗試第三種尋找活性成分的方法:借助超級計算機,對所有候選化合物進(jìn)行測試。這些化合物原則上可以由COVID-19
Moonshot項目的合約制造商之一合成。Schleifer說道:“可能的化合物多達(dá)約12億種,我們就其抑制新冠病毒主蛋白酶的潛力進(jìn)行一一計算?!笔褂贸売嬎銠C計算的優(yōu)勢在于,所有可能的活性分子都可以快速合成,然后在實驗中接受測試。巴斯夫?qū)⑼ㄟ^COVID-19
Moonshot項目公開這些結(jié)果。
Eckes說道表示:“非常高興可以發(fā)揮我們在化學(xué)方面的特殊專長支持藥物活性成分研究,并為學(xué)術(shù)研究團隊提供真實和虛擬的活性分子。這或許有助于早日研發(fā)出抗新冠藥物?!?
幫助學(xué)術(shù)研究團體尋找抗新冠活性成分是巴斯夫“‘手'護”行動的眾多舉措之一。在全球范圍內(nèi),巴斯夫計劃投入總額超過1億歐元的抗疫資金。
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