-- 巴斯夫開放其包含數(shù)百萬條目的物質庫,供科研團隊免費使用
-- 超級計算機Quriosity助力公共研究項目識別并優(yōu)化潛力分子
作為“‘手’護”行動的一部分,巴斯夫不僅捐贈了大量消毒劑和防護口罩,還在全球范圍內為學術研究團體提供支持,幫助尋找合適的活性成分,用于治療感染新冠肺炎的患者。巴斯夫生物科學研究平臺總裁Peter
Eckes博士表示:“雖然我們沒有藥物活性成分研發(fā)業(yè)務,但巴斯夫在物質研究方面擁有超過150年的經(jīng)驗。這意味著我們擁有大量的相關知識和囊括多種活性成分的大型物質庫?!卑退狗蜻€開發(fā)了自己的計算機程序,用于分子設計,并擁有自己的超級計算機Quriosity。Eckes補充道:“充分發(fā)揮我們強大的研究能力,為抗擊新冠疫情貢獻一份力量?!睘榇耍退狗蛘ㄟ^多種方式幫助尋找病毒解藥。
為快速找到有效抑制新冠病毒的活性成分,世界各地的學術機構正通過細胞培養(yǎng)測試已批準藥物的有效性,雖然這些藥物已用于治療其他病毒性疾病,但可能對新冠病毒作用有限,因此有必要尋找活性成分的改進衍生物。為此,巴斯夫研究人員對公司內部包含數(shù)百萬種分子的物質庫進行了計算機輔助搜索,以尋找類似的化合物,并最終確定了150種有希望的候選化合物。巴斯夫免費向各大學術工作團隊提供這些化合物,并允許其用于研究,無需支付任何專利費。巴斯夫生物科學研究員Matthias
Witschel博士說道:“多年來,我們一直在支持瘧疾等傳染病的藥物學術研究。因此,‘手’護行動才能迅速調用我們早已建立的人脈和流程?!?
用超級計算機Quriosity模擬活性分子
來自計算化學部的化學家們提出了第二種尋找活性成分的方法,即利用計算機領域知識。隨后,他們得知一家生物技術公司PostEra正開展COVID-19
Moonshot項目,參與該項目的全球科學家自愿幫助尋找一種抑制劑,通過抑制新冠病毒必需的一種酶——病毒主蛋白酶,阻止病毒在人體內自我復制。巴斯夫研究人員也加入其中,共同尋找有效抑制劑,在巴斯夫內部開發(fā)的計算機程序和超級計算機Quriosity的幫助下設計出許多新型分子。最終,他們通過模擬找到了20個最適合主蛋白酶活性位點的分子,并將相關分子信息免費提供給該項目,作進一步研究。
巴斯夫數(shù)字生物科學研究部的計算化學主任Klaus-Jürgen
Schleifer教授解釋道:“然而,這些通過計算機模擬得來的分子,我們并不確定它們能否被合成,合成度有多高?!贬槍@一問題,巴斯夫研究人員也在嘗試第三種尋找活性成分的方法:借助超級計算機,對所有候選化合物進行測試。這些化合物原則上可以由COVID-19
Moonshot項目的合約制造商之一合成。Schleifer說道:“可能的化合物多達約12億種,我們就其抑制新冠病毒主蛋白酶的潛力進行一一計算。”使用超級計算機計算的優(yōu)勢在于,所有可能的活性分子都可以快速合成,然后在實驗中接受測試。巴斯夫將通過COVID-19
Moonshot項目公開這些結果。
Eckes說道表示:“非常高興可以發(fā)揮我們在化學方面的特殊專長支持藥物活性成分研究,并為學術研究團隊提供真實和虛擬的活性分子。這或許有助于早日研發(fā)出抗新冠藥物?!?
幫助學術研究團體尋找抗新冠活性成分是巴斯夫“‘手’護”行動的眾多舉措之一。在全球范圍內,巴斯夫計劃投入總額超過1億歐元的抗疫資金。